MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 296785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014318	CTCG	2	8	18225	18232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_014318	CAG	2	6	18280	18285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781950
503	NC_014318	CGG	2	6	18301	18306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781950
504	NC_014318	GGCC	2	8	18308	18315	0 %	0 %	50 %	50 %	300781950
505	NC_014318	TCG	2	6	18324	18329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781950
506	NC_014318	CGT	2	6	18385	18390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781950
507	NC_014318	TCG	2	6	18399	18404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781950
508	NC_014318	TCA	2	6	18408	18413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300781950
509	NC_014318	CTC	2	6	18416	18421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781950
510	NC_014318	CGGC	2	8	18492	18499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_014318	GC	3	6	18498	18503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_014318	G	6	6	18509	18514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014318	CCGG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_014318	GCG	2	6	18563	18568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781951
515	NC_014318	GTC	2	6	18597	18602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781951
516	NC_014318	GCC	2	6	18632	18637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781951
517	NC_014318	GTG	3	9	18638	18646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781951
518	NC_014318	CGGG	2	8	18709	18716	0 %	0 %	75 %	25 %	300781951
519	NC_014318	CAG	2	6	18721	18726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781951
520	NC_014318	GACG	2	8	18736	18743	25 %	0 %	50 %	25 %	300781951
521	NC_014318	GGA	2	6	18793	18798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300781951
522	NC_014318	TGCGG	2	10	18890	18899	0 %	20 %	60 %	20 %	300781951
523	NC_014318	AGA	2	6	18900	18905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300781951
524	NC_014318	GAGC	2	8	18928	18935	25 %	0 %	50 %	25 %	300781951
525	NC_014318	CGG	2	6	19098	19103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781951
526	NC_014318	CACG	2	8	19123	19130	25 %	0 %	25 %	50 %	300781951
527	NC_014318	GCG	2	6	19180	19185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781951
528	NC_014318	CG	3	6	19184	19189	0 %	0 %	50 %	50 %	300781951
529	NC_014318	GTG	2	6	19220	19225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781951
530	NC_014318	GCC	2	6	19289	19294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781951
531	NC_014318	CGGCG	2	10	19425	19434	0 %	0 %	60 %	40 %	300781952
532	NC_014318	GGC	2	6	19464	19469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781952
533	NC_014318	CGT	2	6	19500	19505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781952
534	NC_014318	CAG	2	6	19519	19524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781952
535	NC_014318	GCG	2	6	19568	19573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781952
536	NC_014318	CCG	2	6	19613	19618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781953
537	NC_014318	GCA	3	9	19738	19746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781953
538	NC_014318	CGT	2	6	19864	19869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781953
539	NC_014318	CTCG	2	8	19890	19897	0 %	25 %	25 %	50 %	300781954
540	NC_014318	GCG	2	6	19916	19921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781954
541	NC_014318	CTT	2	6	19960	19965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300781954
542	NC_014318	GATC	2	8	19986	19993	25 %	25 %	25 %	25 %	300781954
543	NC_014318	ACC	2	6	20008	20013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781954
544	NC_014318	GCC	2	6	20029	20034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781954
545	NC_014318	CGTC	2	8	20218	20225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_014318	CGT	2	6	20296	20301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014318	TAGT	2	8	20312	20319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014318	CCG	2	6	20409	20414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781955
549	NC_014318	GC	3	6	20546	20551	0 %	0 %	50 %	50 %	300781955
550	NC_014318	GCC	2	6	20670	20675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781955
551	NC_014318	GCT	2	6	20694	20699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781955
552	NC_014318	CTG	2	6	20776	20781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781955
553	NC_014318	CCAC	2	8	20834	20841	25 %	0 %	0 %	75 %	300781955
554	NC_014318	CGC	2	6	20892	20897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781955
555	NC_014318	GCAGC	2	10	20914	20923	20 %	0 %	40 %	40 %	300781955
556	NC_014318	CA	3	6	20967	20972	50 %	0 %	0 %	50 %	300781955
557	NC_014318	GC	3	6	20990	20995	0 %	0 %	50 %	50 %	300781955
558	NC_014318	GC	3	6	21021	21026	0 %	0 %	50 %	50 %	300781955
559	NC_014318	CCGA	2	8	21040	21047	25 %	0 %	25 %	50 %	300781955
560	NC_014318	ACG	2	6	21053	21058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781955
561	NC_014318	GC	3	6	21065	21070	0 %	0 %	50 %	50 %	300781955
562	NC_014318	GCG	2	6	21107	21112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781955
563	NC_014318	CGA	2	6	21129	21134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781955
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565	NC_014318	CTG	2	6	21181	21186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781955
566	NC_014318	CAGCC	2	10	21189	21198	20 %	0 %	20 %	60 %	300781955
567	NC_014318	CGT	2	6	21201	21206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781955
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569	NC_014318	CGC	2	6	21264	21269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781955
570	NC_014318	GAC	2	6	21309	21314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781955
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574	NC_014318	CGA	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014318	TAG	2	6	21669	21674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014318	GAA	2	6	21762	21767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014318	CGT	2	6	21793	21798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_014318	C	7	7	21801	21807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
579	NC_014318	GAGT	2	8	21866	21873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014318	AG	3	6	21894	21899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014318	ATC	2	6	21937	21942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300781956
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584	NC_014318	ATCCC	2	10	22001	22010	20 %	20 %	0 %	60 %	300781956
585	NC_014318	TTG	2	6	22094	22099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300781956
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587	NC_014318	CG	3	6	22136	22141	0 %	0 %	50 %	50 %	300781956
588	NC_014318	GTC	2	6	22154	22159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781956
589	NC_014318	GTAG	2	8	22200	22207	25 %	25 %	50 %	0 %	300781956
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592	NC_014318	GCTC	2	8	22294	22301	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
593	NC_014318	CAGC	2	8	22315	22322	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
594	NC_014318	CG	3	6	22341	22346	0 %	0 %	50 %	50 %	300781956
595	NC_014318	GCTC	2	8	22405	22412	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
596	NC_014318	CAGC	2	8	22426	22433	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
597	NC_014318	TGG	2	6	22477	22482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781956
598	NC_014318	GCTC	2	8	22510	22517	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
599	NC_014318	CCA	2	6	22524	22529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781956
600	NC_014318	TAGC	2	8	22531	22538	25 %	25 %	25 %	25 %	300781956
601	NC_014318	CT	3	6	22604	22609	0 %	50 %	0 %	50 %	300781956
602	NC_014318	CAGC	2	8	22624	22631	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
603	NC_014318	CT	3	6	22715	22720	0 %	50 %	0 %	50 %	300781956
604	NC_014318	CAGC	2	8	22735	22742	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
605	NC_014318	CT	3	6	22826	22831	0 %	50 %	0 %	50 %	300781956
606	NC_014318	GGC	2	6	22916	22921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781956
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608	NC_014318	TGCC	2	8	22960	22967	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
609	NC_014318	CAG	2	6	23023	23028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781956
610	NC_014318	CGGC	2	8	23037	23044	0 %	0 %	50 %	50 %	300781956
611	NC_014318	GCG	2	6	23064	23069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781956
612	NC_014318	TGA	2	6	23152	23157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300781956
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616	NC_014318	TTC	2	6	23345	23350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300781956
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618	NC_014318	CTC	2	6	23438	23443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781956
619	NC_014318	CAA	2	6	23570	23575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300781956
620	NC_014318	GGC	2	6	23651	23656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781956
621	NC_014318	CAGC	2	8	23699	23706	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
622	NC_014318	ATCCGC	2	12	23732	23743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300781956
623	NC_014318	CAG	3	9	23858	23866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781956
624	NC_014318	CGG	2	6	23923	23928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781956
625	NC_014318	GAT	2	6	23948	23953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300781956
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628	NC_014318	CAC	2	6	24110	24115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781956
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630	NC_014318	CAC	2	6	24155	24160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781956
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758	NC_014318	CGCGG	2	10	29870	29879	0 %	0 %	60 %	40 %	300781961
759	NC_014318	CGT	2	6	29893	29898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781961
760	NC_014318	CGG	2	6	29970	29975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781961
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762	NC_014318	CGT	2	6	30007	30012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781961
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774	NC_014318	GGC	2	6	30404	30409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781962
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779	NC_014318	CGA	2	6	30542	30547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781962
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782	NC_014318	ACC	2	6	30661	30666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781962
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784	NC_014318	CGT	2	6	30689	30694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781962
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790	NC_014318	CGG	2	6	30818	30823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781962
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792	NC_014318	TCG	2	6	30862	30867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781962
793	NC_014318	CAG	2	6	30870	30875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781962
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799	NC_014318	CCG	2	6	31070	31075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781962
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819	NC_014318	CGCC	2	8	31673	31680	0 %	0 %	25 %	75 %	300781962
820	NC_014318	TCG	2	6	31741	31746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781962
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834	NC_014318	GCA	2	6	32147	32152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781962
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837	NC_014318	CGG	2	6	32284	32289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781962
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862	NC_014318	CGG	2	6	33260	33265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781962
863	NC_014318	CGA	2	6	33290	33295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781962
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865	NC_014318	GCG	2	6	33451	33456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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867	NC_014318	CAC	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
868	NC_014318	GAAAG	2	10	33516	33525	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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871	NC_014318	CGC	2	6	33774	33779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781963
872	NC_014318	CGC	2	6	33791	33796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781963
873	NC_014318	CCG	2	6	33826	33831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781963
874	NC_014318	AGC	2	6	33887	33892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781963
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882	NC_014318	ACCT	2	8	34123	34130	25 %	25 %	0 %	50 %	300781963
883	NC_014318	ACG	2	6	34196	34201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781963
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